Внутри компьютерной системы, известной как Сеть, существует огромный цифровой мир, населённый разумными программами. Когда-то его создал программист Кевин Флинн, рассчитывая построить совершенную систему. Управлять Сетью в его отсутствие должна была программа Клу, созданная по образу самого Флинна. Но стремление Клу к абсолютному порядку постепенно превращает его в жестокого правителя. Он захватывает власть в Сети и начинает устанавливать собственные законы. Главный защитник системы Трон пытается остановить переворот, но терпит поражение и после сражения считается уничтоженным. Одним из городов, оказавшихся под властью Клу, становится Аргон. Контроль над ним получает генерал Теслер, который вместе со своими солдатами подавляет любое сопротивление. Большинство местных программ предпочитает подчиниться, поскольку открытый протест практически неизбежно заканчивается уничтожением. В Аргоне живёт молодой механик Бек. Он работает в гараже вместе со своими друзьями Зарой и Боди и поначалу не собирается становиться борцом с режимом. Всё меняется, когда действия солдат Теслера затрагивают близких ему программ. Бек решает дать захватчикам отпор. Чтобы скрыть свою личность и одновременно напомнить жителям о прежнем защитнике Сети, он надевает костюм Трона. Неожиданно его поступок становится символом сопротивления и даёт другим программам надежду. Вскоре Бек узнаёт, что настоящий Трон жив. Он получил тяжёлые повреждения во время сражения с Клу и теперь скрывается от его армии. Трон понимает, что сам уже не способен вести прежнюю борьбу, поэтому выбирает Бека своим преемником. Под руководством Трона молодой механик начинает тренироваться. Он учится сражаться на дисках, управлять световыми циклами и использовать возможности Сети. При этом Беку приходится продолжать обычную жизнь, чтобы никто из друзей не узнал о его тайне. Теслер тем временем пытается найти неизвестного противника, которого жители начинают принимать за вернувшегося Трона. Чем активнее Бек сопротивляется оккупации, тем опаснее становится охота на него. Теперь ему предстоит не только выжить, но и доказать программам Аргона, что власть Клу действительно можно свергнуть.
