Мегамозг много лет был одним из самых известных злодеев Метро-Сити. Теперь всё изменилось. После очередного спасения города бывшему преступнику приходится привыкать к совершенно новой роли и становиться настоящим супергероем. Вместе с ним остаётся его верный помощник Чам. Он знает Мегамозга лучше остальных и помогает другу справляться с проблемами, которые постоянно возникают из-за его необычных решений. Рядом оказывается и Роксана Ричи. Теперь она занимает пост мэра Метро-Сити и старается поддерживать порядок в городе, пока Мегамозг осваивает обязанности его главного защитника. К команде присоединяется юная Кейко Морита. Она восхищается новым героем и мечтает сама участвовать в его приключениях. Мегамозгу нравится быть спасителем города, но отказаться от старых привычек оказывается непросто. Он по-прежнему обожает эффектные появления, сложные изобретения и грандиозные планы. Кроме того, ему недостаточно просто совершать подвиги. Мегамозг хочет, чтобы жители видели, насколько хорошо он справляется с новой работой. Для этого мозгоботы начинают записывать его приключения. Так бывший злодей решает стать первым в мире супергероем-инфлюенсером и рассказывать о своих подвигах огромной аудитории. Но популярность героя постоянно подвергается испытаниям. Однажды в городе появляется Дюд Манки, который тоже хочет защищать жителей и быстро привлекает к себе внимание публики. В других случаях проблемы создаёт сам Мегамозг. Его изобретения выходят из-под контроля, а попытки исправить небольшую ошибку иногда заканчиваются угрозой для всего города. Один эксперимент приводит к тому, что обычный таракан превращается в настоящего гения. В другой раз технология обмена телами заставляет Мегамозга и Роксану буквально поменяться местами. Чаму тоже приходится разбираться с последствиями собственных экспериментов. Желание успеть выполнить все дела заставляет его создать несколько копий самого себя, но очень скоро клоны перестают облегчать жизнь. Кейко тем временем хочет доказать, что тоже способна стать героем. Когда Мегамозг отказывается обучать её, девушка самостоятельно отправляется на опасное задание и проникает в Синдикат Рока. Но гораздо серьёзнее оказывается появление Макиавиллейна. Загадочный злодей строит собственные планы на Метро-Сити и постепенно становится одним из главных противников Мегамозга. Бывшему суперзлодею приходится использовать знания, которые он получил за годы преступной жизни. Теперь хитрые планы и невероятные устройства нужны ему не для захвата города, а для его спасения. Каждое новое приключение становится очередным уроком. Мегамозг постепенно понимает, что настоящий герой должен не только побеждать злодеев и нравиться публике, но и отвечать за людей, которых решил защищать.
