После масштабной катастрофы на Земле люди начали активно осваивать другие планеты Солнечной системы. К 2071 году на Марсе, Венере и спутниках газовых гигантов появились крупные поселения, между которыми регулярно летают космические корабли. Однако вместе с развитием новых колоний увеличилось количество преступлений. Для поимки опасных беглецов власти назначают награды, привлекая независимых охотников за головами. Одними из таких охотников становятся Спайк Шпигель и Джет Блэк. Они путешествуют на старом корабле «Бибоп», разыскивают преступников и постоянно пытаются заработать достаточно денег для оплаты топлива, ремонта и продуктов. Джет отвечает за управление кораблём и организацию заданий, а Спайк предпочитает действовать быстро, полагаясь на боевые навыки и собственную удачу. Джет раньше работал полицейским и считался хорошим следователем. Однако предательство напарника привело к тяжёлому ранению, после которого он потерял руку. Теперь вместо неё у него механический протез. Оставив службу, Джет решил работать самостоятельно, хотя продолжает поддерживать отношения с некоторыми бывшими коллегами. Спайк тоже скрывает немало тайн. До знакомства с Джетом он был участником могущественного преступного синдиката «Красный дракон». Вместе с Вишесом он выполнял поручения руководства и участвовал в опасных операциях. Однако дружба между мужчинами закончилась после того, как Спайк полюбил Джулию, с которой состоял в отношениях Вишес. Чтобы вырваться из преступного мира, Спайк инсценировал собственную гибель. Он надеялся сбежать вместе с Джулией, но их план сорвался. Девушка осталась рядом с Вишесом, а Спайк начал новую жизнь, стараясь не вспоминать о прошлом. Однако бывший напарник продолжает считать его предателем и не собирается прощать. Во время очередного задания Спайк и Джет встречают Фэй Валентайн, ловкую мошенницу, которая тоже занимается поисками преступников. Девушка пытается заработать деньги и разобраться в собственном прошлом, поскольку практически ничего не помнит о жизни до криогенного сна. Обстоятельства заставляют её остаться на «Бибопе» и работать вместе с новыми знакомыми. Троица отправляется на поиски разыскиваемых преступников, которые скрываются на разных планетах. Им приходится сталкиваться с вооружёнными бандами, опасными убийцами и торговцами запрещёнными веществами. Каждая операция требует тщательной подготовки, но непредсказуемое поведение Спайка часто приводит к перестрелкам, погоням и разрушениям. Постепенно между членами экипажа возникают доверительные отношения, хотя каждый продолжает скрывать собственные проблемы. Джет пытается наладить общение с дочерью Кимми, которую редко видит после развода. Фэй ищет документы и людей, способных рассказать о её происхождении. Спайк же старается не допустить, чтобы друзья узнали о его связях с преступным синдикатом. Тем временем Вишес начинает борьбу за руководство «Красным драконом». Он пытается избавиться от старых лидеров организации и занять их место. Джулия оказывается в сложном положении, поскольку вынуждена жить рядом с человеком, который становится всё более жестоким и подозрительным. Постепенно она начинает искать возможность освободиться от его контроля. Когда Вишес узнаёт, что Спайк жив, он организует поиски бывшего друга. Преступный синдикат начинает угрожать не только самому Спайку, но и людям, с которыми тот связан. Джет и Фэй неожиданно обнаруживают, что их напарник скрывал гораздо больше, чем они предполагали. Спайк понимает, что больше не сможет избегать встречи с Вишесом. Он решает разобраться с прошлым и выяснить, что произошло с Джулией. Однако борьба внутри синдиката принимает неожиданный оборот, а прежние отношения между участниками конфликта оказываются гораздо сложнее, чем казалось. Последнее столкновение заставляет Спайка, Джета и Фэй пересмотреть отношение друг к другу. Последствия борьбы с «Красным драконом» разрушают привычную жизнь экипажа, а неожиданное решение Джулии меняет положение всех участников противостояния.
