Группа людей соглашается навсегда покинуть Землю и начать новую жизнь на далёкой планете Теа. Каждый из них получает возможность оставить прошлое позади. Компания «Siren» обещает колонистам жильё, работу и шанс стать частью нового общества, которое строится практически с нуля. Путешествие должно пройти на огромном космическом корабле «Происхождение». Большую часть пути пассажиры проводят в состоянии искусственного сна. Но несколько человек неожиданно просыпаются раньше положенного срока. Корабль кажется полностью покинутым. Коридоры пусты. Члены экипажа исчезли. Большинство пассажиров тоже покинули свои капсулы или пропали неизвестно куда. Среди оставшихся оказывается Лана Пирс. На Земле она служила в американских правоохранительных органах и привыкла действовать в опасных ситуациях. Теперь её опыт становится особенно полезным. Рядом находится Логан Мейн, бывший телохранитель, который согласился отправиться на Теа после событий, заставивших его отказаться от прежней жизни. К ним присоединяется Шун Кензаке. Он вырос в Японии и связан с преступным миром, от которого надеялся избавиться после перелёта. В группе также оказываются доктор Генри Гасана, Эвелин Рей, Эбигейл Гарсия и другие пассажиры. Почти никто из них раньше не был знаком. Единственное, что их объединяет, это желание оказаться как можно дальше от Земли. Сначала пассажиры пытаются понять, почему их разбудили. Они ищут экипаж и проверяют системы корабля. Постепенно становится ясно, что произошла серьёзная авария. Связаться с людьми, которые должны управлять полётом, не получается. Часть отсеков повреждена. Некоторые помещения заблокированы. А автоматические системы не дают достаточно информации о произошедшем. Очень скоро обнаруживается ещё одна проблема. На корабле они могут быть не одни. В закрытых помещениях появляются следы неизвестного существа. Некоторые пассажиры начинают вести себя странно. Возникает подозрение, что на «Происхождение» проникла чужая форма жизни. Она способна использовать человеческое тело и скрываться среди людей. Теперь любой из выживших может оказаться носителем. Пассажиры начинают подозревать друг друга. Никто не знает, каким образом определить заражённого. Человек может разговаривать и выглядеть совершенно нормально, пока находящееся внутри него существо не решит действовать. Попытки восстановить произошедшее постоянно возвращают героев к их прошлому. Лана вспоминает события, из-за которых решила оставить Землю. Логан скрывает собственную историю. Шун не рассказывает окружающим всего о своей семье и людях, с которыми был связан раньше. У каждого пассажира находится причина, по которой билет на Теа оказался для него значительно больше обычного путешествия. Новая колония должна была дать им возможность начать заново. Но прошлое продолжает влиять на решения даже посреди космоса. Некоторые участники группы привыкли доверять только себе. Другие пытаются взять управление на себя. Любой конфликт становится особенно опасным, потому что уйти с корабля невозможно. Лана старается сохранять порядок. Она понимает, что паника только поможет неизвестному противнику. Но чем больше группа узнаёт о случившемся, тем труднее становится доверять даже тем, кто находится рядом с самого пробуждения. Постепенно выясняется, что эвакуация корабля произошла не случайно. Экипаж столкнулся с угрозой, которую не смог остановить обычными средствами. Оставшиеся пассажиры теперь должны самостоятельно завершить то, с чем не справились подготовленные специалисты. Им приходится проникать в закрытые отсеки, восстанавливать системы и искать записи экипажа. Каждая новая находка меняет представление о событиях на «Происхождении». Неизвестная форма жизни оказывается значительно опаснее, чем они предполагали. Она умеет приспосабливаться и использует людей для собственного выживания. При этом определить её намерения практически невозможно. Группа не знает, случайно ли существо оказалось на корабле или его появление связано с самой миссией. Расстояние до Теа постепенно сокращается. Но теперь пассажиры уже не уверены, что прибытие станет спасением. Если заражение попадёт в колонию, последствия могут оказаться значительно серьёзнее гибели одного корабля. Остановить угрозу нужно до посадки. Для этого Лане, Логану, Шуну и остальным приходится раскрывать тайны, которые они собирались навсегда оставить на Земле. Чем меньше становится выживших, тем сильнее подозрения. Любая странность в поведении может означать страх. А может быть признаком того, что перед ними уже не тот человек, которого они знали несколько часов назад. Постепенно борьба за управление кораблём превращается в попытку выяснить, кто из пассажиров всё ещё остаётся человеком. И когда «Происхождение» приближается к цели, становится ясно, что главная опасность может скрываться не в повреждённых системах и не в пустых коридорах. Она всё это время находится среди тех, кто рассчитывал вместе начать новую жизнь на Теа.