Элитная школа-интернат «Чёрная лагуна» находится вдали от города, посреди большого леса. Здесь живут и учатся дети состоятельных и влиятельных семей, а строгие правила должны полностью отделять их от проблем внешнего мира. В начале нового учебного года в интернат приезжают Маркос Новоа Пасос и его младшая сестра Паула. Их родители бесследно исчезли во время морского путешествия и считаются погибшими. Но дети продолжают надеяться, что однажды они вернутся. Маркосу приходится одновременно привыкать к новой школе и заботиться о Пауле. Девочка тяжело переживает исчезновение родителей и верит, что с ними произошло нечто совсем иное, чем утверждают взрослые. Вскоре Маркос знакомится с другими учениками. Среди них Иван, Каролина, Виктория, Роке и Каэтано. Отношения между подростками складываются непросто, но постепенно они оказываются втянуты в общую тайну. В это же время в интернате появляется новая горничная Мария Альмагро. Незадолго до этого она сбежала из психиатрической клиники и теперь вынуждена скрывать своё прошлое. Много лет назад у Марии отняли маленького сына. После долгих поисков она получает сведения, что мальчик находится именно в «Чёрной лагуне». Поэтому работа горничной становится для неё единственной возможностью приблизиться к нему. Никто из учеников не подозревает о настоящей причине её появления. Мария внимательно наблюдает за подростками и пытается определить, кто из них может оказаться её ребёнком. Тем временем вокруг школы начинают происходить странные события. Особенное беспокойство вызывает окружающий интернат лес, куда ученикам запрещено ходить без разрешения. Местные истории рассказывают о людях, которые исчезали среди деревьев и больше никогда не возвращались. Поначалу подростки воспринимают эти рассказы как обычные страшилки, но вскоре сами находят доказательства того, что в лесу действительно что-то происходит. Маркос и его друзья начинают собственное расследование. Найденные предметы и старые документы приводят их к событиям, случившимся задолго до их появления в интернате. Постепенно выясняется, что тайны окружают не только лес. Некоторые сотрудники школы знают гораздо больше, чем рассказывают ученикам, а прошлое самого здания связано с людьми, которые предпочли бы навсегда сохранить определённые события в секрете. Одновременно Маркос пытается найти сведения о родителях. Чем больше он узнаёт о «Чёрной лагуне», тем сильнее подозревает, что их исчезновение может быть связано с происходящим вокруг школы. Обычный учебный год постепенно превращается для подростков в опасное расследование. За стенами интерната скрываются старые преступления, исчезновения и секреты, раскрытие которых может поставить под угрозу жизнь каждого, кто приблизится к правде.
