Эллиот Алдерсон работает инженером по кибербезопасности в нью-йоркской компании «Allsafe». Днём он защищает компьютерные системы крупных клиентов, а по ночам самостоятельно ищет людей, которые скрывают преступления и опасные тайны. Эллиоту сложно общаться с окружающими. Даже обычный разговор требует от него усилий, поэтому большую часть времени он проводит перед компьютером. Его ближайшей подругой остаётся Анджела Мосс. Они знакомы с детства, работают в одной компании и хорошо знают семьи друг друга. Одним из главных клиентов «Allsafe» является огромная корпорация «E Corp». Эллиот ненавидит её и даже мысленно называет Evil Corp. Причины такой ненависти связаны с прошлым. Отец Эллиота работал на компанию и тяжело заболел после воздействия вредных веществ. Семья Анджелы тоже пострадала из-за деятельности корпорации. Однажды ночью Эллиот обнаруживает серьёзную атаку на серверы «E Corp». Во время расследования он находит сообщение, оставленное специально для него. Вскоре с ним связывается загадочный мужчина, называющий себя Мистером Роботом. Он знает о способностях Эллиота и предлагает присоединиться к группе fsociety. Участники fsociety собираются нанести удар по «E Corp» и уничтожить данные о долгах миллионов людей. Они считают, что таким образом смогут лишить корпорацию огромной части власти. Эллиот оказывается перед сложным выбором. По работе он обязан защищать «E Corp», но план Мистера Робота направлен против компании, которую он сам считает виновной во многих бедах. Он знакомится с другими участниками группы. Среди них Дарлин, которая быстро показывает, что знает об Эллиоте значительно больше, чем обычная новая знакомая. Постепенно Эллиот всё глубже втягивается в подготовку атаки. Ему приходится скрывать свои действия от коллег и одновременно продолжать работу в «Allsafe». Проблемы возникают и внутри «E Corp». Молодой руководитель Тайрелл Уэллик отчаянно пытается подняться по карьерной лестнице и готов использовать практически любую возможность для получения более высокого положения. Эллиот замечает, что Тайрелл отличается от остальных руководителей корпорации. Их встречи становятся всё более странными, а интерес Уэллика к нему постепенно выходит за рамки обычной работы. Тем временем отношения Эллиота с Мистером Роботом тоже меняются. Новый союзник постоянно подталкивает его к действиям, которые сам Эллиот считает слишком рискованными. Некоторые события начинают противоречить его воспоминаниям. Эллиот замечает пробелы в собственной памяти и понимает, что не всегда способен доверять тому, что считает реальностью. Особенно много вопросов вызывает Дарлин. В определённый момент выясняется, что их связь существует гораздо дольше, чем помнит сам Эллиот. Правда о Мистере Роботе оказывается ещё более неожиданной. Человек, которого Эллиот воспринимал как отдельного лидера fsociety, связан с ним намного теснее. Несмотря на происходящее, операция против «E Corp» продолжается. Подготовленная атака получает название «5/9» и должна изменить финансовую систему страны. После её осуществления последствия оказываются совсем не такими простыми, как представляли участники fsociety. Вместо освобождения от власти корпораций общество сталкивается с экономическим хаосом. «E Corp» пытается восстановить потерянные данные и вернуть контроль. А за произошедшими событиями постепенно обнаруживается влияние китайской хакерской группировки Dark Army и её загадочного руководителя Уайтроуз.
